Межконфессиональный иммиграционный совет Манитобы возник после Второй мировой войны, когда «перемещенные лица» должны были заявить о своей религиозной принадлежности для въезда в страну. Различные конфессии стремились помочь своей интеграции в Канаду с помощью помощи, оказываемой в портах въезда. Имея общие цели и интерес к иммиграции и иммиграционной политике, организация разных церквей выросла вместе.

К 1960 году был сформирован Национальный межконфессиональный иммиграционный комитет с региональными отделениями, работающими по своим собственным принципам.

Региональный совет Манитобы, созданный в 1968 году, оказывал социальную и моральную поддержку вновь прибывшим через работу волонтеров. Первый сотрудник, работающий неполный рабочий день, был обеспечен средствами Федерального департамента занятости и иммиграции.

С 1976 по 1979 год этот сотрудник помогал новичкам адаптироваться в Манитобе. Офисные помещения и расходы были предоставлены церковными конфессиями. В 1980 году Объединенная церковь Св. Андрея в Элгине встретилась с MIIC, чтобы отреагировать на приток индокитайских беженцев. С помощью денег, собранных церквями, и федерального гранта был нанят общественный работник из Юго-Восточной Азии. В 1982 и 1983 годах федеральные и провинциальные гранты продолжали и расширяли услуги со вторым общественным работником и координатором.

В 2000 году Межконфессиональный иммиграционный совет Манитобы подписал соглашение с правительством Канады о финансировании беженцев, «связанных с семьями», и предоставлении спонсорской помощи членам семей беженцев, рекомендованным группами избирателей в этнокультурном сообществе Манитобы.

Сегодня услуги включают в себя параюридические услуги лицам, ходатайствующим о предоставлении статуса беженца, помощь в семейном спонсорстве, информацию и консультации для беженцев за границей, а также полный спектр услуг (прием, расселение) для беженцев, получающих помощь от правительства и частных лиц.